Termik santrallerin yanı sıra son zamanlarda hidroelektrik santraller üzerine de çalışmaya başlamış bulunmaktayız. Hidroelektrik santralleri termik santrallerden ayıran en önemli nokta üretim kaynaklarının kısıtlılığıdır. Eğer havzasında su tutabiliyorsa, bu suyun ne zaman hangi miktarda kullanılacağı sorusu hiroelektrik santrallerin önündeki en önemli problemdir. Santralin su tutma kapasitesi yoksa veya çok düşükse, üretilecek enerjinin birkaç günlük tahmini problemi önem kazanır. Hidroelektrik santrallerin üretim maliyetinin hesaplanması sorunu başlıbaşına bir problemdir. Bir doğalgaz santralinin en önemli değişken üretim maliyeti doğalgaz giderleridir. Hidroelektrik santrallerde ise ilk bakışta kaydadeğer bir değişken üretim maliyeti söz konusu değilmiş gibi algılanabilir çünkü görünüş itibariyle elektrik üretiminde kullanılan su, satış fiyatına kıyasla oldukça düşük bir değişken maliyete sahiptir. Kar ediliyor olsa da her saatte üretim yapılmalı mıdır, yoksa eldeki kısıtlı su miktarı ile yapılacak üretim elektrik fiyatlarının en yüksek olduğu saatlere mi kaydırılmalıdır? Eğer böyle yapılacaksa, bu hesap nasıl yapılabilir ve bu şekilde hareket etmenin barındırdığı risk nedir? Bu sorular havzasında su tutabilen ve üretimini erteleyebilen hidroelektrik santrallerin önündeki büyük problemlerdir. Nehir tipi hidroelektrik santrallerin önünde ise daha farklı problemler bulunmaktadır.